Com 24 anos de existência, a Mata Ciliar foi fundada na cidade de Pedreira, no interior do Estado. Em 1997, Jundiaí foi contemplada com o trabalho da instituição que, apesar levar no nome os ideais de conservação da flora, iniciou também algo que seria inevitável – o cuidado com animais que viviam nessas matas e precisavam da ajuda humana para continuarem a viver, senão em seu habitat natural, mas dentro da própria instituição.